分布
正己烷在体内分布与官的脂肪含量有关，主要分布于脂肪含量高的官，如脑、肾等。
转化
正己烷的生物转化主要在脏，微粒体细胞色素P450及细胞色素C直接参与其氧化代谢。代谢产物有2-己醇、3-己醇、2-己酮、2，5-己二酮等。
排泄 正己烷及其代谢产物自肺和肾排出。人肺可排出正己烷50%~60%。大鼠在一次或反复接触3600毫克/立方米后48h从组织内消除，天津正己烷生产，以原形由肺排出。在代谢产物中主要的为2-己醇和2，5己二酮，它与环境正已烷浓度密切相关，均经肾由尿排出。尿中2，5己二酮可作为接触正己烷生物检测指标。
正己烷中毒是指接触正己烷引起的疾病。急性中毒表现为头晕、、恶心，并有眼和呼吸道粘膜的刺激症状。慢性中毒可主要表现为多发性周围神病及、肾损害。正己烷中毒主要通过呼吸道、皮肤、消化道进入人体，毒类型可分急、慢性两种。高浓度正己烷急性中毒，主要表现为咳嗽、气急、气喘、头晕、、恶心等呼吸道刺激症状和系统醉性抑制，严重者可发生化学性炎和肺肿 。当食入量达50g时，天津正己烷订购，可致死亡。溅入眼内可引起结膜刺激症状。慢性中毒主要表现为四肢远端指、趾对称性麻木感，触痛觉反应迟钝，四肢疲软无力，脚踝部痉挛，手腕、足可出现下垂。重者下肢可瘫痪，肌肉萎缩，体重减轻，痛觉消失。多发性周围病及、肾损害。除脱离接触外，可给予对症。正己烷中毒没有特药。
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